Анализ микробиома кишечника более успешно отличал здоровых людей от людей с предраковыми аденоматозными полипами и людей с инвазивным колоректальным раком по сравнению с оценкой клинических факторов риска и анализом фекальной скрытой крови, согласно данным, опубликованным в журнале Cancer Prevention Research, журнале Американской ассоциации. для исследования рака.
"Микробиом кишечника человека – это совокупность всех бактерий в его кишечнике," сказал Патрик Д. Шлосс, доктор философии, доцент кафедры микробиологии и иммунологии Мичиганского университета в Анн-Арборе. "Количество бактерий в кишечнике огромно; он в 10 раз превышает количество клеток в нашем организме, а разнообразие присутствующих бактерий имеет решающее значение для нашего здоровья. Посредством секвенирования области V4 гена 16S рРНК мы смогли идентифицировать бактерии, присутствующие в микробиоме кишечника каждого человека.
"Мы обнаружили, что состав микробиома кишечника позволяет нам определить, у кого в нашем исследовании были предраковые аденоматозные полипы, а у кого – инвазивный колоректальный рак," продолжил Schloss. "Если наши результаты подтвердятся на больших группах людей, добавление анализа кишечного микробиома к другим тестам кала может обеспечить улучшенный неинвазивный способ скрининга на колоректальный рак."
Анализируя образцы стула у 90 человек – 30 здоровых людей, 30 пациентов с предраковыми аденоматозными полипами и 30 пациентов с инвазивным колоректальным раком – Шлосс и его коллеги установили, что состав микробиома кишечника был различным для людей в трех группах.
Используя эту информацию, они определили сигнатуры микробиома кишечника для каждой группы. Добавление анализа этих признаков к оценке возраста и расы, которые являются клиническими факторами риска предраковых аденоматозных полипов, улучшило прогноз наличия предраковых аденоматозных полипов 4.5-кратный. Добавление анализа сигнатур кишечного микробиома к оценке возраста, расы и индекса массы тела (ИМТ), которые являются клиническими факторами риска инвазивного колоректального рака, улучшило прогнозирование наличия инвазивного колоректального рака 5.4-кратный.
Кроме того, анализ сигнатур микробиома кишечника был лучше, чем анализ кала на скрытую кровь, при различении людей с предраковыми аденоматозными полипами от людей с инвазивным колоректальным раком (AUC = 0.617 и AUC = 0.952 соответственно). Совместная оценка ИМТ, результатов анализа кала на скрытую кровь и сигнатур кишечного микробиома дополнительно улучшила способность различать эти два состояния (AUC = 0.969).
"Наши данные показывают, что анализ микробиома кишечника может стать новым инструментом неинвазивного скрининга колоректального рака," сказал Шлосс. "Мы не думаем, что это когда-либо заменит другие подходы к скринингу колоректального рака, скорее мы рассматриваем его как дополнительные.
"В исследовании участвовали не только микробиологи, но и исследователи, обладающие опытом в области статистики, геномики и эпидемиологии," продолжил Schloss. "Его успех показывает, насколько важна междисциплинарная наука."