Новый ‘генетический штрихкод’ техника показывает детали последовательности клеточных поколений

Развитие могло ускорить наше понимание множества клеточных процессов. В то время как несколько различных методов существуют для отслеживания последовательностей клеточных поколений, у каждого есть ограничения.

Например, краски могут использоваться, чтобы отследить создание дочерних клеток, но не обеспечивают понимание отношений между клетками потомка.Здесь, Аарон Маккенна и коллеги разработали поисковый метод происхождения под названием Редактирование Генома Синтетических Целевых Множеств для Отслеживания Происхождения (ГЕШТАЛЬТ). Метод вводит уникальные образцы мутаций в отличную, короткую генетическую последовательность, названную геномным штрихкодом. Последовательность ДНК видоизмененных штрихкодов в дочерних клетках тогда используется, чтобы восстановить отношения последовательности клеточных поколений.

Маккенна и др. демонстрирует эффективность этой техники в клеточной культуре и живом данио-рерио. После представления штрихкодов в зачаточном состоянии данио-рерио и анализа различных тканей на взрослой стадии, исследователи нашли, что всего несколько эмбриональных клеток – предшественников дают начало большинству клеток, которые составляют взрослые органы.Например, только 5 из 1 138 генных вариантов, наблюдаемых у четырехмесячного данио-рерио, дали начало больше чем 98% клеток крови.

Авторы отмечают, что эта новая техника может использоваться в будущих исследованиях, чтобы отследить более сложные, многоклеточные процессы в нормальном развитии, и что это может также использоваться, чтобы определить клеточное происхождение опухолей и метастаз.