Они издали свои результаты сегодня в журнале Nature.Известный его красотой и также как важный источник еды, подсолнечник – глобальные масличные культуры, которые показывают обещание для адаптации изменения климата, потому что это может поддержать стабильные урожаи через большое разнообразие условий окружающей среды, включая засуху. Однако сборка генома подсолнечника до недавнего времени была трудной, потому что это главным образом состоит из очень подобных, связанных последовательностей.Исследовательская группа в Северной Америке и Европе упорядочила геном одомашненного подсолнечника Helianthus annuus L. Они также выполнили сравнительные и исследования всего генома, которые обеспечивают понимание эволюционной истории Asterids, подгруппы цветущих растений, которая включает картофель, помидоры и кофе.
Они определили новые гены-кандидаты и восстановили генетические сети, которые управляют цветущим временем и нефтяным метаболизмом, двумя главными чертами размножения подсолнечника, и нашли, что цветущие сети времени были сформированы прошлым дублированием всего генома. Их результаты предполагают, что древние копии генов могут сохранить свою функциональность и все еще влиять на черты интереса после десятков миллионов лет.
«Как первая справочная последовательность генома подсолнечника, это – вполне выполнение», сказал бумажный соавтор Джон М. Берк, преподаватель биологии завода и член Центра Завода UGA. «Геном подсолнечника более чем на 40 процентов больше, чем кукуруза [зерно] геном и примерно на 20 процентов больше, чем геном человека, и его очень повторяющийся характер сделал его уникальной проблемой для собрания».Разделайтесь, чья лаборатория изучает геномное основание эволюционного расхождения в семействе подсолнечников, был вовлечен в генетическое отображение, после которого собрание генома базировалось и наблюдало за целым геномом, повторно упорядочивающим из 80 рядов подсолнечников, описанных в газете.Международное сотрудничество было во главе с Николасом Лэнглэйдом во французском Национальном Институте Сельскохозяйственного Исследования в Тулузе, Франция, и включало Лорена Рисеберга из Университета Британской Колумбии.
«Как много геномов завода, геном подсолнечника очень повторяющийся, хотя в этом случае ситуация немного хуже», сказал Берк. «Повторяющиеся элементы в геноме возникли относительно недавно, означая, что у них не было времени, чтобы дифференцироваться. Это поэтому похоже на соединение крупной загадки, где много частей смотрят точно то же самое, или почти так».
Авторы пришли к заключению, что это исследование укрепляет подсолнечник как модель для экологических и эволюционных исследований и адаптации изменения климата, и ускорит программы разведения.«Это значительно облегчит нашу работу, чтобы понять молекулярные механизмы, лежащие в основе ключевых черт, связанных с неживым сопротивлением напряжения – вещи как засуха, соленость и низкое питательное сопротивление», сказал Берк. «Эта последовательность генома будет по существу служить генетическим планом действий, чтобы точно определить гены, лежащие в основе этих видов черт».