Две команды, работающие независимо друг от друга, обнаружили, что можно выявить паттерны экспрессии генов в лимфоцитах, инфильтрирующих опухоль, с помощью секвенирования одноклеточной РНК. Первая команда из Австралии секвенировала лимфоциты, проникшие в опухоли рака груди. Вторая команда, базирующаяся в Китае, сделала то же самое с лимфоцитами, которые проникли в опухоли рака легких и окружающие ткани. Обе команды описывают свои выводы и результаты в журнале Nature Medicine.
Лимфоциты – это разновидность лейкоцитов (белых кровяных телец), которые, как правило, существуют в основном в лимфатической системе. Одним из конкретных типов являются Т-клетки, которые, как хорошо известно, играют важную роль в иммунном ответе на чужеродный материал. Раковые опухоли рассматриваются иммунной системой как чужеродный материал, и поэтому на них нацелены Т-клетки и другие лимфоциты. К сожалению, таких целевых атак недостаточно, чтобы остановить рост или распространение многих опухолей. В этих новых усилиях обе команды стремились получить лучшее представление о том, какие типы иммунных ответов имеют больший успех, чем другие. Чтобы выяснить это, они провели секвенирование одноклеточной РНК на лимфоцитах, участвующих в таком ответе, – на тех, которые инфильтрировали опухоли.
Команда, работающая в Австралии, сосредоточила свое исследование на лимфоцитах, участвующих в борьбе с опухолями рака груди. С этой целью они секвенировали 6311 Т-клеток из двух основных типов опухолей рака груди. Оба типа рака ранее считались трижды отрицательными из-за их специфических характеристик.
Команда из Китая изучила лимфоциты, которые проникли в опухоль рака легких. Они секвенировали 12 346 единичных Т-клеток из опухолей и близлежащих тканей. В их случае опухоли представляли 14 различных типов. Они также секвенировали 8038 альфа- и бета-рецепторов Т-клеток.
В обоих исследованиях исследователи сообщают, что им удалось выявить паттерны экспрессии генов. Команда из Австралии, например, обнаружила, что как количество, так и качество инфильтрирующих Т-лимфоцитов могут влиять на результат прогрессирования опухоли. И команда в Китае обнаружила, что они могут отслеживать мигрирующие клоны эффекторных Т-клеток, которые фактически различались от одной ткани к другой.
Обе команды предполагают, что их работа показывает потенциальные преимущества понимания одноклеточной геномики микросреды опухоли – возможность разработки новых иммунотерапевтических препаратов и методов.