Грегори Цонгалис, PhD
Используя секвенирование ДНК следующего поколения, ученые из Дартмута определили потенциально действенные мутации при раке аппендикса. Их исследование, "Молекулярное профилирование опухолей аппендикулярного эпителия с использованием параллельного секвенирования для выявления соматических мутаций," был опубликован в журнале Clinical Chemistry сегодня. Когда определены специфические мутации для типа рака, пациентов можно лечить химиотерапией или другими целевыми агентами, которые работают с этими мутациями.
Мало что известно о молекулярной биологии двух типов опухолей аппендикса, низкоуровневого муцинозного новообразования аппендикса (LAMN) и аденокарциномы, но оба могут привести к псевдомиксоме брюшины (PMP), критическому состоянию, при котором раковые клетки бесконтрольно растут вдоль стенки живот и может раздавить органы пищеварения.
Патологи Дартмута изучили 38 образцов опухолей LAMN и аденокарциномы (некоторые из которых прогрессировали до PMP) из своих архивов, чтобы найти общие генетические ошибки, которые могут быть ответственны за аномальный рост клеток. Образцы тканей были секвенированы с использованием панели AmpiSeq Hotspot Cancer Panel v2, которую патологи проверили для клинического скрининга мутаций в 50 общих генах, связанных с раком, для которых существуют методы лечения. Это было первое исследование, в котором использовалась мультигенная панель при раке аппендикса для поддержки использования потенциальных таргетных методов лечения.
"Мы регулярно используем этот подход молекулярного профилирования ко всем нашим аденокарциномам легких, меланомам, раку толстой кишки и глиомам," сказал Грегори Цонгалис, доктор философии, главный исследователь и директор отделения молекулярной патологии в онкологическом центре Дартмута-Хичкока Норриса Коттона. Он говорит, что изучение индивидуального профиля опухоли может значительно изменить исход болезни в положительную сторону.
Мутации KRAS и GNAS были наиболее частыми изменениями, выявленными в исследовании. Двенадцать различных аномалий были картированы с геном KRAS. Были выявлены дополнительные мутации (i.е., AKT1, APC, JAK3, MET, PIK3CA, RB1 и STK11 для LAMN и TP53, GNAS и RB1 для аденокарциномы) в четырех изученных типах образцов. Семь из этих мутаций были характерны для более чем одной группы, что предполагает некоторое молекулярное сходство.
"Эти данные свидетельствуют о том, что опухоли аппендикса, хотя и редки и очень агрессивны, представляют собой отдельные сущности и имеют подклассы заболеваний в каждой категории, которые отличаются друг от друга в зависимости от их мутационного профиля," сказал Цонгалис. "Новые терапевтические подходы могут быть способны воздействовать на те пути, которые мутируют в этих типах опухолей."
Это лабораторное исследование может изменить клиническую практику, если врачи теперь разработают планы лечения, направленные на выявленные генетические мутации. "Наш успех в отделении патологии Медицинского центра Дартмут-Хичкок в онкологическом центре Норриса Коттона объясняется нашим междисциплинарным подходом к этим открытиям, которые действительно позволяют нам переносить научные результаты со скамейки прямо у постели больного," сказал Цонгалис.