Сходящаяся эволюция регуляции генов в людях и мышах

Новое исследование, опубликованное 15 января на Слушаниях Национальной академии наук, было во главе с исследователями в Санта-Крузе UC и Медицинском центре Университета Рочестера. Они описали сложную систему, которая регулирует те же самые гены таким же образом в обеих разновидностях, все же развитых независимо в этих двух происхождениях.В обоих случаях регулятивная система включает некодирующую РНК (последовательности, не переведенные на молекулы белка) с происхождением в сегментах ДНК, беспорядочно вставленных в геном «подскакивающими генами» (ретротранспозоны).«Это исследование подчеркивает важность некодирования РНК и взаимозаменяемых элементов в регулировании экспрессии гена и в эволюции сетей экспрессии гена в геномах млекопитающих», сказал соавтор Мануэль Арес, преподаватель молекулярных, клетки и биологии развития в Санта-Крузе UC.

Только приблизительно 2 процента генома человека скопированы в молекулы РНК посыльного, чтобы закодировать для белков, которые управляют главными процессами во всех клетках. Большая часть остальной части генома расшифрована в некодирование РНК, функция которой в основном неизвестна, но которая подозревается в игре множества ролей в регуляции генов и эволюции.Многие из этих некодирующих РНК скопированы с повторных последовательностей ДНК, названных короткими вкрапленными ядерными элементами (СИНУСЫ).

После того, как расшифрованный в РНК, они могут быть скопированы назад в ДНК и «приклеены» в геном в новых местоположениях в процессе, названном retrotransposition. Иногда эти новые копии земля в или около генов и могут повредить их.

Другие времена они могут добавить новые свойства к гену.В геноме человека главная семья СИНУСА сделана из так называемых «элементов Alu». Есть больше чем 1 миллион копий Alu, включая больше чем 10 процентов ДНК человека, рассеянной всюду по геному, и некоторые из них, вероятно, все еще в состоянии подскочить к новым местоположениям.У генома мыши, однако, нет Alus; вместо этого у этого есть отличный набор СИНУСОВ по имени элементы B/ID.

У различных геномов млекопитающих есть различные СИНУСЫ, потому что периодические взрывы retrotransposition различными СИНУСАМИ продолжали происходить после разделения различных разновидностей от их последних общих предков. В случае человека и мыши, их происхождения отличались приблизительно 90 миллионов лет назад.

«Удивительно, когда мышь и геномы человека были сравнены, местоположения СИНУСОВ были очень похожи, даже при том, что сами СИНУСЫ и события, которые разместили их в тех местоположениях, очень отличались», сказал Арес. «Интересно, что могло объяснить эту очевидную сходимость вставки СИНУСА в двух независимо развивающихся геномах».Лаборатория Линн Мэкуэт в Университете Рочестера нашла, что СИНУСЫ, которые сажают в части генетического кода хвосты РНК посыльного (названный 3-лучшим непереведенным регионом или 3 ‘-UTR) приносят mRNA под контролем белка под названием Staufen, который вниз – регулирует выражение гена процессом, названным «Staufen-установленный распад» или SMD. Отдельные примеры установленного СИНУСОМ SMD были ранее зарегистрированы и в человека и в клетки мыши в каждом случае с различными СИНУСАМИ.

Так как современные СИНУСЫ в человеке и геномах мыши не были в общем предке, все изменения в экспрессии гена, которые зависят от СИНУСОВ, должно быть, произошли после людей и мышей, отделенных, а не в их общем предке.«Обычно мы думаем о важных системах управления экспрессии гена как развивавшийся давно, но для регулирования установленным СИНУСОМ SMD, это не может иметь место», объяснил Арес. «Вопрос, который мы задали, был: Есть ли какие-либо случаи, где тот же самый ген у мыши и человека был принесен под установленным СИНУСОМ SMD, хотя используя различные СИНУСЫ в какой-то момент во время отдельных эволюционных историй мышей и мужчин? Если так, сколько?

И насколько распространенный является сходящаяся эволюция гена регулирующими сетями? Как часто СИНУСЫ играют роль в критически изменяющемся контроле за экспрессией гена?»

Эти вопросы исследовались в сотрудничестве между Рочестером и лабораториями UCSC, в которых предшествующие клетки мышц (myoblasts) от обоих организмов были проанализированы, чтобы опознать генные пары (мышь и человеческое генное кодирование для того же самого белка), которому вставили СИНУС в mRNA хвост и находился под контролем Staufen. Примеры таких генных пар в числах, больше, чем ожидалось случайно, сигнализировали бы о возможности сходящейся эволюции Staufen регулирующая сеть в myoblasts, где SMD, как известно, важен для генного контроля.В myoblasts исследователи смогли обнаружить 24 гена, которые и отрегулированы Staufen и имеют определенные для разновидностей СИНУСЫ. Это – минимальное число потенциально сходящихся пар, потому что не все гены выражены в myoblasts, отметил Арес.

Дополнительные эксперименты в газете подтверждают роль СИНУСА (удаляя его и показывая, что mRNA становится стабильным и нечувствительным к присутствию Staufen) для двух генных пар.


Назад

Происхождение приручения верблюда дромадера обнаружено

Далее

Инженеры получают контроль над активностью гена, искусственно создавая ключевой компонент эпигенома

19 комментариев

  1. Hugiginn

    В Минске разве что стоящие рестораны есть, а в Бресте одни столовки.

  2. Януть Семён

    Не знаю, не знаю. Винниччина – чисто украинский регион.

  3. Gardagami

    В США не был, не знаю.

  4. Coth

    Украина уже давно не часть России, также как и Эстония, Молдова, Латвия, Литва, Грузия.

  5. Жарков Вадим

    Там за 10 минут можешь по интернету предприятие зарегистрировать, заказать паспорт или ордер на квартиру, проголосовать можно через интернет. У них сфера ИТ клево рулит.

  6. Мананникова Оксана

    В Чехии ваших мигрантов тоже пруд пруди.

  7. Калинина Диана

    Невступление в совковый таёжный союз.

  8. Dushakar

    Ты хочешь сказать, что среди ваших туристов мало неадекватных "тагииииилов"?

  9. Saige

    Правильно! Саблюкой по мордасам этим сраным коммунясам.

  10. Костиков Степан

    Всё относительно. Мне один голландец, попутчик в австрийском поезде тоже заявлял, что всё, что на восток от Вены – это Азия. Хотя Прагу и Будапешт Азией точно не назовёшь.

  11. Flameblade

    Одесса – русский город? Ну-ну! Хахаха! Когда то вы так же и о Риге рассуждали, а теперь без Шенген-визы вас туда не пустят. То же самое будет и в Одессе!

  12. Пронин Егор

    Да и заметьте! Отели без русских и туры без русских есть, а без украинцев нет. В те отели гражданам РФ вход воспрещен.

  13. Thordi

    А про капитализм нефиг киздеть. Совок уже почил в бозе, потому что совковый строй – это лузерство. В мире нет ни одной успешной коммуняцкой страны, даже в Китае большинство населения пашет по 24 часа в сутки за тарелку риса в день, а красоты Шанхая – это потёмкинские деревни.

  14. Назарова Светлана

    Они уже свой век отжили. И им никогда не привить нашему поколению любовь к Сралину и Берии. Это все равно, что если бы какой-то дедуган приперся на молодежную дискотеку и стал орать – что вы какого-то Армина ван Бюрена из загневаюсчего запада слушаете, это дерьмо, слушайте Зыкину и Кобзона, так его вышибала бы за три секунды выставил.

  15. Фонвизин Кирилл

    Тагииииил! Тагиииил, бляяяяя! Путин всех убьёт бляяяяяя! Вот из-за такого неадекватного гопнического поведения в мире существуют уже туры без русских и отели без русских. На вас руссаков смотрят как на потенциальных преступников.

  16. Morlumand

    Гугл Впомощь — 24.03.2015, 14:25
    безвизовый в Молдавии–радость лишь в том,что срок пребывания до полугода в течении 365 дней и не надо покупать визу и ВСЕ.Работать нельзя,при пересечении границы–те же бумаги,что при оформлении визы,наличка,подтверждения возврата,и места пребывания.
    ======================================
    =====================================
    Так меня такие условия устраивают. А то попробуй с польским или латышским шенгеном поедь в Германию. "Зайчика" в паспорт поставят и скажут – за нарушение пребывания в Шенгене – бан на десяток лет. Да и билет с отелем не проблема. Это же не справка о недвижимости или заверенный нотариально перевод трудовой, как это у меня требовали в посольстве Италии.

  17. Митрофанов Виталий

    Менты в Питере просто тупо по беспределу стали требовать взятку под угрозой расправы. В РФ ментовка ведь до сих пор репрессивная – был бы человек, а статья всегда найдется.

  18. Salas

    Ну у меня родной украинский, так что имею право ошибаться в русском.

Добавить комментарий