Северный олень (Rangifer tarandus) является единственными полностью одомашненными разновидностями у оленя, или Cervid, семьей. Это – также единственный олень, у которого есть международное распределение: охватывая арктический, тундра, субарктические, арктические и гористые области северной Азии, Северной Америки и Европы. В отличие от всего другого cervids, это не просто олени мужского пола, которые выращивают и теряют рога, но также и женщин. С точки зрения животноводства молоко северного оленя намного более богато белком и имеет меньше лактозы, чем коровье молоко.
Последний аспект делает доступность этого молока интереса, учитывая высокий процент лактозы нетерпимыми людьми в мире. С этим множеством характерных особенностей доступность последовательности генома северного оленя может обеспечить все полные салазки новой информации и является желанным новым участником в элитный клуб одомашненных разновидностей со справочными геномами, включая корову, овец и козу.Эта работа была выполнена командой китайских исследователей из китайской Академии Сельскохозяйственных Наук в Чанчуни и Северо-западного Политехнического Университета в Сиане.
Исследователи взяли образец крови от двухлетнего, северного оленя женского пола одомашненного стада, сохраняемого кочевыми охотниками-пастухами Ewenki в Больших Горах Khingan в Китае. Они упорядочили, собрали, аннотировали геном и показали, что это имело высокое качество. Сравнение генома северного оленя к геномам связанных разновидностей и людям, показанным, что размер генома северного оленя (2,6 ГБ или 2,6 миллиарда пар оснований) немного меньше, чем тот из людей, коров и коз, и о том же самом размере как овцы.Первый автор газеты, Жепинг Ли, адъюнкт-профессор в Институте Специальных Наук Животного и растения в китайской Академии Сельскохозяйственных Наук, отметил, что анализ также определил «335 определенных для северного оленя генов, которые, вероятно, помогут в понимании специальных биологических особенностей северного оленя.
Они могли также быть очень полезными в понимании эволюции северного оленя, а также всей семьи Cervid в будущих сравнительных исследованиях геномики между северным оленем и другими жвачными животными».С этой целью в памяти, исследователи также построили эволюционное дерево, используя новый геном и уже доступные геномы членов бычьей семьи.
Они нашли, что северный олень, коровы и козы отделились от общего предка приблизительно 29,6 миллионов лет назад. Это было в течение олигоценовой эпохи, где одно из существенных изменений было глобальным расширением в полях.
Эта статья была одним из победителей вступительного соревнования GigaScience и следа приза, который используется, чтобы продвинуть новый, ультрасовременный, исследование. Авторы представили свою работу на специальной сессии на 12-й ежегодной Международной конференции ГРАФИЧЕСКОГО ИНТЕРФЕЙСА ФИРМЫ BORLAND по вопросам Геномики в Шэньчжэне в пятницу 27-го октября.
Как соревнование по открытой науке это и статьи других победителей были рассмотрены полностью открытым способом, где общественность могла следовать за всем процессом публикации от наличия статьи проекта, открыто доступной в предварительном сервере печати Biorxiv, процесс экспертной оценки, сделанный живой с обзорами, сделанными доступный до решения публикации в Академической системе обзора наложения Кармы, сопровождаемой редакционными решениями, пересмотрами рукописи и публикацией статьи со всем редактором, автором, и корреспонденция рецензента сделала доступным с опубликованной статьей.