Всесторонний геномный анализ опухолей головного мозга низкой степени злокачественности разделяет их на три категории, одна из которых имеет молекулярные признаки и сокращает выживаемость мультиформной глиобластомы, самой смертельной из опухолей головного мозга, сообщили исследователи на ежегодном собрании Американской ассоциации исследований рака в 2014 г.
"Непосредственное клиническое значение состоит в том, что группу пациентов с опухолями, ранее отнесенными к более низкой степени, следует лечить как пациентов с глиобластомой и получать такой стандарт лечения – химиотерапию темозоломидом и облучение," сказал ведущий автор Роэл Верхаак, Ph.D. доцент кафедры биоинформатики и вычислительной биологии онкологического центра им. М. Д. Андерсона Техасского университета.
"Классификация опухолей более низкой степени злокачественности в этих трех молекулярных кластерах более точно характеризует их, чем современные методы, используемые для группировки и классификации опухолей," Верхаак сказал.
Основные молекулярные маркеры, которые определяют три опухолевых кластера – мутационный статус генов IDH1 и IDH2 и потеря хромосомных плеч 1p и 19q – уже регулярно проверяются в клинической практике, отметил Верхаак, поэтому внедрение новых категорий можно осуществить относительно быстро.
Верхаак и его коллеги проанализировали данные исследований опухолей головного мозга в Атласе генома рака (TCGA).
Отсутствие мутаций IDH1 / 2 резко снижает выживаемость
Опухоли головного мозга возникают в глии или поддерживающих клетках головного мозга и теперь классифицируются по их гистологии – характеристикам, видимым с помощью микроскопа – и клеткам их происхождения, астроцитам или олигодендроцитам.
Классифицированные таким образом олигодендроглиомы и астроцитомы 2 и 3 степени демонстрируют медианную общую выживаемость пациентов в диапазоне от трех до десяти лет. Это по сравнению с 14 месяцами для пациентов с мультиформной глиобластомой – сложной и агрессивной астроцитомой.
Глиобластомы составляют 55-60 процентов глиом, при этом астроцитомы более низкой степени злокачественности составляют 15-20 процентов случаев, олигодендроциты – 12-20 процентов, а комбинированные олиго-астроцитомы – 5-10 процентов.
Исследователи всесторонне проанализировали 254 глиомы TCGA более низкого ранга на предмет экспрессии генов, белков и микроРНК, метилирования ДНК и профилей копий генов, чтобы сгруппировать случаи по категориям. Затем они провели "кластер кластеров" анализ, охватывающий все данные.
"Результаты в подавляющем большинстве указывают на естественную группировку глиом более низкого уровня в три суперкластера на основе мутационного статуса генов IDH1 и IDH2 и ко-делеции плеч хромосом 1p и 19q," Верхаак сказал.
Предыдущее исследование TCGA показало, что пациенты с глиобластомой с мутациями IDH1 / IDH2 в опухолях имеют улучшенный прогноз. Верхаак сказал, что неизвестно, являются ли эти мутации маркерами хорошего прогноза или действительно играют роль в предотвращении прогрессирования опухоли. Ко-делеция 1p19q была связана с повышенной чувствительностью опухоли к химиотерапии и более длительным выживанием пациентов с олигодендроглиомой.
Каждая молекулярная группа включает опухоли всех степеней и категорий астроцитомы, олигодендроцитомы и олигоастроцитомы
Три молекулярных суперкластера глиом более низкого уровня имеют либо: