Сначала подробная расшифровка сложного генома проса пальца

Для многих бедных фермеров в Индии и Африке, просо пальца – главная основная еда. Разновидность урожая не только богатый источник полезных ископаемых как кальций, железо, магний и цинк, и это содержит много витаминов и существенных аминокислот. Завод также характеризуется его сопротивлением засухе и теплу. Поскольку это очень здорово и без глютена, это находит увеличенное использование в качестве еды в индустриальных странах также.

Несмотря на его важность, просо пальца уделили очень мало научного внимания до сих пор.Большой и сложный геном из-за сплава двух видов растений

Просо пальца возникло посредством гибридизации двух различных видов растений. Завод – поэтому полиплоид, что означает, что у этого есть четырехкратный набор хромосом и почти вдвое большего количества генов как его оригинальные разновидности.

Размер и сложность генома, как думают, присудили широкую экологическую терпимость проса пальца, делая исследование генома чрезвычайно трудным. Впервые, международной команде исследователей из Цюрихского университета теперь удалось расшифровать сложный геном проса пальца в мельчайших подробностях.

Это включает приблизительно 2,6 миллиона пар оснований и имеет больше чем 62 300 генов – о вдвое больше как рис, например.Новая стратегия генома, упорядочивающего и наносящего на картуХорошие 57 900 проса пальца гены – более чем 90 процентов – происходит больше чем в двух копиях. Поскольку их последовательности ДНК очень похожи, было трудно правильно ассигновать многочисленные, расшифрованные разделы DNA во всем геноме.

В сотрудничестве с Ральфом Шлэпбаком и Сирисой Алури от Функционального Центра Геномики в Цюрихском университете и Швейцарской высшей технической школе Цюриха, команде, возглавляемой Кентаро Симидзу, преподавателем в Отделе UZH Эволюционной Биологии и Экологических Исследований, удалось преодолеть эти трудности. С этой целью ученые объединили сложную стратегию биоинформатики, разработанную Masaomi Hatakeyama, который использует современные упорядочивающие методы с новой технологией, которая может оптически нанести на карту длинные, отдельные Молекулы ДНК в геноме. «Наша недавно разработанная стратегия поможет упорядочить геном других полиплоидных культивируемых растений, которые не были в состоянии быть определенными до сих пор», говорит Симидзу.

Улучшение поставки питательных веществ и сопротивления засухиМеждисциплинарная команда исследователей из Цюриха и Бангалора, Индия, сотрудничала на этом проекте.

Работа была поддержана швейцарским Индо Сотрудничеством в Биотехнологии (ISCB), двусторонняя научно-исследовательская программа, финансированная швейцарскими и индийскими правительствами, а также Службой Науки и техники Японии. Цель состоит в том, чтобы улучшить продовольственную безопасность и развивать способность биотехнологического исследования в Индии. «Недавно доступные данные о геноме проса пальца открывают многочисленные возможности для современного размножения завода», подчеркивает Симидзу. «С одной стороны, чтобы помочь людям с минеральными дефицитами в Индии и в промышленно развитых странах и, с другой стороны, сделать важные хлебные злаки более стойкими к засухе и засушливости».