Чтобы обойти этот недостаток информации, международное сотрудничество исследователей из Японии (Kumamoto University & RIKEN), Россия (Казань федеральный Университет), Испания (Университет Cantabria), и Австралия (Университет Западной Австралии) соединило первый в мире набор всего генома птичьего TSSs. Эти места отмечают отправную точку для транскрипции и чрезвычайно важны для клеточной дифференцировки и развития эмбриона до рождения, или, в случае птичьей разновидности, до штриховки. В то время как птицы выглядят очень отличающимися от людей, ранние стадии развития очень похожи, и было показано, что приблизительно у 60% человеческих кодирующих белок генов есть непосредственная корреспонденция курице orthologs (гены, которые развились от общего предка).Используя технологию КЛЕТОК, очень надежный метод для нахождения TSSs и регулирующих СНГ элементов (те блоки последовательности, регулирующие положение и надежность транскрипции) в геноме по полному птенцу период развития, сотрудники смогли нанести на карту 60% всего куриного TSSs развития к новому куриному геному с другими 40%, вероятно, являющимися на данный момент неохарактеризованными альтернативными покровителями или некодирующими гены РНК.
Обновленный геном был добавлен к интерактивной, платформе RIKEN онлайн ZENBU (Японское слово «zenbu» переводит ко «всем» на английском языке.) под именем «Курица-ZENBU» и свободно для всех использовать (связь: http://fantom.gsc.riken.jp/zenbu/).Исследователи также показали, что к их отображению TSS всего генома можно было относиться CRISPR-на технология, чтобы активировать определенные гены во время развития, успешно активируя ген T для кодирования белка Brachyury в стадии развития HH10 (приблизительно 1,5 дня развития после наложения). Этот успех был развит несколькими более успешными активациями генов, таким образом, показывающими эффективность CRISPR-на, когда объединено с отображением TSS.«В процессе развития нашего ОСНОВАННОГО НА КЛЕТКЕ TSS развития профильный метод мы определили новые транскрипционные факторы и их регулирующие модули, а также несколько новых вспомогательных генов», заявил руководитель проекта профессор Гоцзюнь Шэн IRCMS Университета Кумамото. «Мы ожидаем эту работу и данные, мы добавили к ZENBU базу данных онлайн, чтобы значительно продвинуть исследование развития и у птиц и у млекопитающих».
Это исследование было издано онлайн в находящемся в открытом доступе журнале PLOS Biology 5 сентября 2017.