Партнер по грибам Arbuscular mycorrhizal приблизительно 65-75% наземных растений, чтобы предоставить им питательные вещества от почвы взамен сахара, сделанного во время фотосинтеза. Эти грибковые сообщества оказывают большое влияние на типы заводов, которые могут вырасти в конкретном месте, и ученые стремятся узнать больше о своем разнообразии и своих экологических эффектах.
Однако природа arbuscular mycorrhizae означает, что грибы растут в растительных тканях, таким образом, это может быть хитро, чтобы сказать, какие разновидности присутствуют в конкретной окружающей среде.Хотя упорядочивающая ДНК использовалась, чтобы определить приблизительно 350 из самых богатых arbuscular mycorrhizal грибы в определенных регионах, эти подходы вряд ли дадут полную картину разновидностей в конкретной окружающей среде.
Чтобы лучше характеризовать разнообразие arbuscular, mycorrhizal грибы, доктор философии кандидат Бенджамин Морган и его наблюдатель доктор Луиза Эджертон-Уорбертон развивал новую технику, способную к обнаружению более редких грибковых разновидностей в сообществе, прокладывая путь к будущему пониманию того, как они могли бы измениться в ответ на изменения окружающей среды. Их результаты изданы в недавней проблеме Применений в Растениеводстве.Морган и Egerton-Уорбертон основывался на недавних достижениях в характеристике arbuscular mycorrhizal сообщества, приспосабливая доказанные определенные для гриба инструменты упорядочивающего ДНК для использования с современными технологиями.
Они добавили признак «штрихкода» к капсюлям, молекулы, которые связывают с ДНК, чтобы позволить им использоваться с чрезвычайно чувствительным оборудованием для упорядочивающего ДНК высокой пропускной способности, чтобы обнаружить более редкие разновидности.Исследователи использовали этот новый подход, чтобы проанализировать почву и образцы корня от двух лесов на полуострове Юкатан, Мексика, показывая один из высших уровней богатства разновидностей, зарегистрированного до настоящего времени.
Они определили 2 213 «эксплуатационных таксономических единиц» (OTUs), которые представляют или отдельные разновидности или генетически переменных людей от меньшего набора разновидностей. arbuscular mycorrhizal грибковые сообщества были во власти небольшого количества очень общих грибов; всего 22 OTUs составляли 89% последовательностей ДНК, определенных в исследовании. Морган уточняет, «Большое количество хорошо поддержанного OTUs было удивительно, и вероятно отражает увеличенную чувствительность этого подхода и его способности захватить редкие таксоны, которые были бы легко пропущены в основанном на споре испытании сообщества и других упорядочивающих подходах».Исследователи были также заинтригованы различиями, которые они обнаружили между грибковыми сообществами двух мест исследования, которые имеют очень похожие сообщества завода и на расстоянии только в 50 миль. Щелочность почвы и уровни азота и фосфора в почве привели к определенным группам разновидностей, являющихся более распространенным на одном месте или другом с различиями, являющимися самым явным в более редком OTUs.
Будущие исследования, вероятно, покажут еще много экологических взаимодействий, объясняет Морган: «Это – действительно просто снимок двух arbuscular mycorrhizal сообщества грибов. Учитывая огромную важность влажной/сухой сезонности к экологии этих систем, намного более обширная сезонная передискретизация была основной целью нашего продолжения в настоящее время издаваемой работы».
Грибковые системы Arbuscular mycorrhizal играют важные роли в своей среде, затрагивая заводы, которые могут вырасти там и питательные вещества, которые сохранены и выпущены от почв. Это исследование – многообещающее начало расширения нашего знания этих систем.
Морган продолжает, «Вероятно, что глобальное arbuscular молекулярное грибковое разнообразие намного выше, чем текущие оценки. Учитывая их важность в формировании экосистем, мы интересуемся получением дополнительной информации об этих разновидностях и их возможных функциях, особенно в сообществах, которые, вероятно, претерпят существенное изменение в результате антропогенных беспорядков и изменения климата в ближайшие десятилетия».
Это исследование финансировалось грантом из Института Устойчивости и энергии в Северо-Западном университете.