Рытье глубже в ДНК: Эффективный метод упорядочить геномы хлоропласта: Новая стратегия биоинформатики возвратить plastid последовательность от упорядочивающего целого генома облегчает анализ генома завода

«Поскольку трудно удалить plastid ДНК из ядерной ДНК, много ядерных геномов, доступных в общественных хранилищах, содержат достаточно plastid ДНК, чтобы собрать их соответствующие геномы», объясняет ведущий исследователь Сильвия Гэрейкочеа.По словам исследователей, нескольких фрагментов и, в некоторых случаях, почти все копии генома хлоропласта могут быть найдены в ядерных геномах заводов.

Это вызвано тем, что генетический материал от хлоропластов непрерывно переходил к ядру в течение многих лет эволюции. Хлоропласты, как понимают, произошли из прокариотов, которые были охвачены эукариотами миллионы лет назад.Новый метод Garaycochea и коллегами позволит исследователям стратегически проанализировать эти данные о последовательности целого генома и собрать геном хлоропласта для их завода интереса.

Это менее дорогостоящее и менее трудоемкое, чем другие методы. Определенные утомительные процедуры лаборатории – такие как предшествующая plastid изоляция ДНК, plastid обогащение ДНК и уверенность в справочном геноме – не требуются.«Для восстановления генома хлоропласта после полных данных о последовательности ДНК преднамеренная идентификация читает, что представляют вставки ДНК хлоропласта в ядерный геном, позволил нам достигнуть собрания генома хлоропласта более высокого качества во время – и рентабельный путь», объясняет Гэрейкочеа.

Используя новый метод, Garaycochea и др. извлек данные о последовательности целого генома из красного риса (Oryza sativa L.) и произведенный полный геном хлоропласта, который теперь доступен на GenBank. Полное исследование доступно в недавней проблеме Применений в Растениеводстве.«Мы использовали слабый рис в качестве образцового завода. Этот выбор позволил нам обоим получать представляющую интерес последовательность хлоропласта для исследования и использовать в своих интересах богатство доступной информации, чтобы утвердить наши результаты», говорит Гэрейкочеа.

Анализируя красный рисовый геном, Garaycochea и др. нашел, что plastid передача ДНК более частая, чем ранее мысль. Эти события передачи очень ценны, потому что они могут показать новую информацию об эволюционных отношениях в и между разновидностями.

«В зависимости от времени событий передачи ДНК эти последовательности могут сохранить различные степени подобия оригинальному plastid геному», говорит Гэрейкочеа. «Эти ядерные сегменты ДНК происхождения хлоропласта могут предоставить ценную эволюционную информацию».Тысячам видов растений упорядочили их геномы, но без геномов органоида, ядерные геномы – только одна часть загадки ДНК.

В дополнение к новым эволюционным открытиям геном хлоропласта может предложить глубокий взгляд на важные процессы завода, которые плотно связаны с сегодняшними меняющимися условиями, такими как воздействия избыточного тепла и засухи на фотосинтетической производительности.


6 комментариев к “Рытье глубже в ДНК: Эффективный метод упорядочить геномы хлоропласта: Новая стратегия биоинформатики возвратить plastid последовательность от упорядочивающего целого генома облегчает анализ генома завода”

  1. Сушилова Людмила

    И слава Богу! Я бы никогда в жизни, ни за какие коврижки бы не принял российского гражданства. Ты же посмотри, как на российский паспорт в мире смотрят? Как на рэкетиров и бандитов из солнцевской братвы. Вот какая репутация у россиян в мире: "Тагиииииииил! Тагииииииил! Это Россия бляяяяяяяяя! Гони бабки, бляяяяяяяя! Щас прирежу бляяяяяя! Иди сюда бляяяяяяя! Смотри в глаза бляяяяяяя! Пшолты бляяяяяяяяя!" Вот поэтому и стали появляться туры без русских, гостиницы без русских.

  2. Блохина Вера

    Зеленый Олень — 27.04.2016, 10:48
    `Надо вежливо, но четко сказать украинцам, что они не вступят в ЕС, так как они не европейцы. Евросоюз ведь Египет принимать не будет` -заявил в интервью польскому изданию бывший президент Франции Валери Жискар д‘Эстен.
    =========================================
    ==================================
    Да что вы говорите! Украина между прочим находится на континенте Европа и по ментальности она не менее европейская, чем България. А Египет находится в Африке и там арабы и ислам, так что сравнение не корректно.

  3. Нашим отказали только тем, кто ранее нарушил там правило. Например превысил скорость и штраф не заплатил, проворовался, попал в другую переделку.

Оставьте комментарий