riboswitch – короткий кусок РНК, которая может свернуться в различные структуры, в зависимости от того, является ли маленькая молекула посыльного, связывает с ним. В транскрипционном riboswitches эти различные структуры сигнализируют, чтобы соседняя полимераза РНК продолжила производить РНК или останавливаться. В их недавней публикации в iLife группа Schwalbe и их сотрудники выпустили молекулярные структуры xpt-pbuX riboswitch во вне положения после синтеза и в на положении после закрепления маленьким гуанином молекулы посыльного. Они также продемонстрировали что этот выключатель взятиям на положении определенное количество времени.
Это устанавливает определенное требование на этом регулирующем процессе.Когда полимераза РНК летит вдоль нити ДНК, производя соответствующую РНК, она достигает кодекса для выключателя xpt-pbuX, делает riboswitch и продвигается. Если бы гуанин не вокруг, полимераза РНК обнаружила бы дефолт, вне положения и синтез остановки.
Однако, если бы гуанин должен был связать riboswitch, riboswitch должен был бы повторно свернуться в на положении, и полимераза РНК должна будет достаточно долго ждать, чтобы обнаружить новую структуру. Иначе это всегда прочитывало бы, и тот ген никогда не будет читаться. Schwalbe и коллеги нашли, что просто такая пауза действительно существует, и это закодировано в ДНК.
После производства выключателя xpt-pbuX полимераза РНК сталкивается с этим «местом паузы» на кодексе ДНК и замедляется, позволяя правильное количество времени для riboswitch повторно свернуться.