«Исследования ассоциации всего генома – соответствие генам к болезням и другим чертам – было грандиозным предприятием в человеческой генетике в течение прошлого десятилетия», сказал Абрахам Палмер, доктор философии, преподаватель психиатрии в Медицинской школе Калифорнийского университета Сан-Диего. «Но прогресс не был настолько большим в генетике животных. Поэтому исследователи главным образом использовали помеси врожденных напряжений, лишая возможности точно определять определенные геномные регионы или отдельные гены, связанные с чертой. Кроме того, у нас ранее не было хороших способов животных генотипирования прибыльным способом».
Теперь, в исследовании, опубликованном 4 июля 2016 по своей природе Генетика, команда Паломника использовала 1 200 outbred мышей, которые более подобны естественному населению, чтобы проверить новую рентабельную технику, чтобы искать определенные гены, связанные с 66 различными физическими и поведенческими чертами.«Это – система, которая могла использоваться, чтобы обнаружить гены, связанные с любой сложной чертой, исследователь интересуется в любой модели животных», сказал Палмер. «Мы можем посмотреть на любую черту и быстро разработать гипотезы об определенных генах. Это похоже на исследования ассоциации всего генома в людях, но менее дорогой.
И мы можем посмотреть на определенные черты, что мы не можем в людях».Ранее, только большие области хромосомы могли быть связаны с конкретной чертой мыши или поведением. Метод паломника использует в своих интересах превосходящее смешивание, которое присутствует в outbred населении, чтобы помочь бурить землю к определенным генам, используя два шага: genotype-sequencing, который последовательности приблизительно один процент генома мыши; и упорядочивающая РНК, который определяет только гены, включенные в конкретной ткани, такие как мозг.С этим подходом исследователи нашли многочисленные ассоциации между генами и чертами, с которыми они связаны.
Например, они сообщают, что ген мыши, Azi2 связан с метамфетаминами эффектов, имеет на движениях тела, и что ген мыши Zmynd11 связан с подобным беспокойству поведением. Результаты могут быть клинически релевантными, поскольку у людей есть аналогичные гены, сказал Палмер.
Затем, команда спроектирует мышей, которые определенно испытывают недостаток в этих генах, чтобы определить, действительно причинные ли ассоциации и лучше понять основные механизмы.«Это исследование было чрезвычайно приятно, так как это – первый раз, когда эти два гена были идентифицированы как то, чтобы играть роли в психологических условиях», сказал Палмер. «И теперь мы можем думать о планировании для этих генов или белков, которые они кодируют с новой терапией».