Защитная кепка для бактериальной РНК

Рибонуклеиновые кислоты, прежде всего, служат посыльными или молекулами лесов в клетках, но они также ускоряют ключевые биохимические реакции и регулируют метаболические процессы. В более высоких организмах, эукариотах, у РНК посыльного (mRNA) обычно есть молекулярная кепка в ее начале; эта химическая модификация стабилизирует РНК посыльного, защищая его от деградации и модификации. В преобладающем научном представлении бактериальная РНК испытывает недостаток в этой структуре кепки.

В 2015, однако, профессор Джэшк и его команда обнаружили модификацию в определенных бактериальных РНК, которая структурно подобна кепке на РНК посыльного у эукариотов.Кепка – аденин nicotinamide dinucleotide (NAD), коэнзим, который играет ключевую роль в метаболизме. Если NAD используется в качестве кепки в рибонуклеиновой кислоте, однако, это защищает РНК от деградации и модификации. Как только кепка NAD снята, РНК может быть ухудшена, чтобы начать метаболические процессы.

Профессор Джэшк и его команда определили фермент, известный как NudC, который ответственен за удаление кепки. Гейдельбергские исследователи от Института Аптеки и Молекулярной Биотехнологии преуспели в том, чтобы анализировать NudC от бактерии кишечной палочки, используя кристаллические структуры с высоким разрешением, которые позволили им расшифровать функцию фермента.

Профессор Джэшк подчеркивает, что структурные расследования открывают новую область исследования, потому что должны быть опознаны возможные партнеры по взаимодействию NudC, а также других decapping ферментов у других бактерий. Исследователи надеются, что их текущие результаты подогреют новый интерес в идентификации неизвестных структур кепки в других микроорганизмах, а также их функциональных механизмах.