Исследователи из лаборатории Tauber в Университете Leicester’ s Отдел Генетики начали базу данных онлайн, названную WaspAtlas, чтобы обеспечить понимание генетики и молекулярных данных паразитной осы Nasonia.База данных, созданная доктором философии Лестерского университета студент Натаниэль Дэвис, предоставит информацию о генной аннотации, экспрессии гена, а также ДНК methylation у осы Nasonia.Nasonia – организм модели появления в различных областях биологических наук включая эмбриональное развитие, нейробиологии и эволюции.Доктор Эран Тобер, Лектор в Молекулярной Эволюции в Университете Leicester’ s Отдел Генетики, который привел проект, объяснил: “ Образцовые организмы, такие как плодовая мушка и данио-рерио, были жизненно важны для генетического исследования, и наличие эффективной геномной базы данных обязательно для их успеха.
“ До недавнего времени Дрозофила была главной моделью насекомого, предложив исследователям различные современные генетические инструменты.“ Однако это собирается измениться, так как у нас теперь есть ультрасовременные инструменты, которые позволяют нам использовать других насекомых для исследования. Nasonia обеспечивает несколько преимуществ для исследования, что конкурирующая Дрозофила, такая как присутствие ДНК methylation, который важен для эпигенетики ”
До настоящего времени есть только несколько популярных больших баз данных насекомого, таких как FlyBase (для Дрозофилы плодовой мушки), информационный Ресурс Arabidopsis (TAIR, для завода Arabidopsis), и WormBase (на Caenorhabditis elegans).Команды надеются, что WaspAtlas предоставит подобную услугу научному сообществу Nasonia, предоставляя исследователям инструменты для того, чтобы проектировать и провести их эксперименты.Натаниэль Дэвис сказал: “ Мы получили большую обратную связь от исследователей Nasonia, и сотни посетителей со всего мира получили доступ к WaspAtlas.
“ огромный объем данных, что викарии базы данных и сложность вычислительных процессов требуют чрезвычайно сильных аппаратных средств. WaspAtlas основан на компьютерных серверах, сохраняемых Университетом Leicester’ s ИТ-услуги и мы благодарны за их непрерывную помощь ”Доктор Тобер добавил: “ Мы надеемся, что WaspAtlas будет полезен для широкого ряда исследователей. Тесно связанные виды ос используются сегодня для биологической дезинсекции, и база данных была бы также полезна для исследователей медоносной пчелы, поскольку геном эволюционен тесно связанный ”
Исследование team’ s собственная доля в Nasonia сильный сезонный ответ выставки осы. Их исследование исследует молекулярное основание фотопериодических часов – как животные используют ежегодное изменение дневной длины, чтобы предсказать ближайший сезон.Фотопериодический ответ прочен у ос, где сокращение дня зимой вызывает арест развития.
WaspAtlas, вдоль новых геномных методов, поможет команде понять, как фотопериодические часы работают.Бумажное описание WaspAtlas доступно в Базе данных: Журнал Биологических Баз данных и Курирования в следующей ссылке: http://dx.doi.org/10.1093/database/bav103
Натаниэль Дэвис был поддержан Midlands Integrative Biosciences Training Partnership (MIBTP), которое является Биотехнологией, и Научный совет Биологических наук (BBSRC) – финансировал докторское учебное сотрудничество между университетами Лестера, Уорика и Бирмингема.К WaspAtlas можно получить доступ в следующей ссылке: www.WaspAtlas.com