Крошечная DNA Reader Heralds быстрое, дешевое упорядочивание

Перспектива доступной персонализированной медицины с помощью «упорядочивание генома, в то время как Вы ждете», была принесена шаг ближе этонеделя, когда исследование во главе с университетом Вашингтонского преподавателя физики показало, как крошечный наноразмерный датчик может читатьпоследовательность единственной Молекулы ДНК в пути, обещающем быть дешевым и быстрым.Такой метод мог сделать ДНК, упорядочивающую более широко доступную, позволяющую персонализированную медицину, чтобы помочь людямузнайте, восприимчивы ли они к раку, диабету, склонности и другим болезням с генетическими факторами риска.Йенс Гундлах, описывающий себя как экспериментального физика с интересами к фундаментальной физике и биофизике, иколлеги, напишите об их работе в онлайновой проблеме 26 марта Биотехнологии Природы.

Они описывают, как путем приложения молекулярного двигателя к белковой апертуре нанопоры они умели заставлять нить ДНК двигатьсячерез пору один нуклеотид за один раз, позволяя им прочитать крошечный характерный ионный ток каждого нуклеотида, в aобраз, напоминающий о старых машинах ленты тикера, используемых для чтения информации, передал вниз телеграфные линии.Гандлак сказал СМИ, что их работа показывает «ясный путь к осуществимой, легко произведенной платформе упорядочивания».В их статье команды описывают использование нового метода нанопоры, чтобы правильно идентифицировать шесть уже известных последовательностей ДНКв пределах от 42 — 53 нуклеотидов в длине.

Они уже генетически спроектировали белковую нанопору от бактерии под названием Микобактерия smegmatis размышление(MspA), имеющий апертуру приблизительно 1 миллиардная часть метра в размере, просто достаточно большом, чтобы позволить единственному берегу ДНК проходитьчерез.Они приложили пору MspA в двухслойной мембране липида и купали целое в хлориде калия.

Применение напряжения кмембрана создает ток иона, текущий через белковую пору так, чтобы, когда молекулы проходят через апертуру, ихгенерируйте маленькое, но поддающееся обнаружению, изменение в токе.Идея технологии нанопоры ввести более быстрое, более дешевое упорядочивание ДНК (это сокращает число необходимых шагов, дляпример при чтении генома человека), не является новым.

Существует много продолжающих работать центров частного и научного исследованияэто.Но то, что делает эту систему отличающейся, является ею, позволяет нити ДНК быть вылеченной один nucloetide за один раз, в медленном темпедостаточно идентифицировать каждый из четырех нуклеотидов ДНК, цитозина, гуанина, аденина или тимина, от его характерного тока ионаподпись.Предыдущие системы не были в состоянии различать четыре различных нуклеотида.Гандлак сказал:«Двигатель тянет берег через пору на управляемой скорости десятков миллисекунд за нуклеотид, который является достаточно медленнымбыть в состоянии прочитать текущий сигнал."

Команда сделала двигатель из фермента вирусного повторного исследования названным полимеразой ДНК бактериофага (DNAP) phi29.Исследователи в Калифорнийском университете, Санта-Круз попробовал двигатель с помощью этого фермента, но они использовали различную пору этоне мог отличить нуклеотиды.Команды предполагают, что метод мог использоваться, чтобы определить эпигенетические изменения в ДНК.

Эпигенетические изменения важны для вещейкак рак: они показывают, как инструкции, проводимые в ДНК, могут быть выражены по-другому в клетках.Способность определить эпигенетические изменения «является одним из очарования метода упорядочивания нанопоры», сказал Гандлак.

Программа, которой управляет Национальный научно-исследовательский институт генома человека (NHGRI), помогла финансировать исследование. Программа стремится находитьспособ упорядочить отдельную ДНК меньше чем за 1 000$.Грандлак сказал, что область «двигалась быстро».

Когда программа NHGRI началась, стоимость отдельной последовательности ДНК будетбыли в шести числах. Теперь, «с методами как это это могло бы перейти к 10 долларам или 15-минутный проект генома», онсказанный.

Назад

Планирование для токсина MRSA возможный способ лечить супервирусы

Далее

Упорядочивание генома MRSA могло помочь управлять вспышками

10 комментариев

  1. Mozius

    да те ,которые лет 300 что то строят никак не построят из которых мечтают переместиться ,но визы к сожалению

  2. Колодезев Онуфрий Андронович

    хоть на сопилке

  3. Наумов Мефодий Федосиевич

    Что у путина на уме, то у жириновского на языке

  4. Shaktigami

    канал , почитай таможенный запрет на ввоз

  5. Фотина Мария

    слидком

  6. Shaktigar

    Сглотни дождя чушкарь!

  7. Whiterunner

    двуличие москвы символизирует орел-мутант на гербе раши

  8. Дмитриева Регина

    заплач он простит

  9. Galhala

    пыток не выдержит

  10. Штельмах Дмитрий

    Путину не нужен мир

Добавить комментарий

создано с помощью WordPress & Автор темы: Anders Norén