Больше, лучше, быстрее: 3D структура показывает стратегию швейцарского ножа белка

«Вместо того, чтобы принимать на работу определенные компоненты снаружи, полимераза РНК, мне встроили их уже, который объясняет, почему это больше, и менее отрегулировано, но в то же время более эффективно», говорит Кристоф Мюллер от EMBL, который привел исследование. «Поскольку все уже собрано, нет никакой временной задержки», объясняет Мария Морено-Моркилло, которая выполнила работу.Есть три различных полимеразы РНК, каждая из которых делает определенные типы молекулы РНК. Например, полимераза РНК II делает РНК посыльного – ‘посредник’, который несет информацию, закодированную в ДНК к рибосоме, где это может использоваться, чтобы сделать белок.

Полимеразы РНК I и III делают части оборудования, которое читает ту РНК посыльного: Я строю РНК, которая в конечном счете сформирует рибосому, в то время как III делает РНК передачи, которая несет стандартные блоки белка к рибосоме для собрания. Ученые знали больше десятилетия, на что похожа полимераза РНК II и как это работает, но получающий подробную информацию о структурах ее коллег оказался чрезвычайно трудным. Теперь, когда им удалось сделать так для полимеразы РНК I, Мюллер и коллеги нашли объяснения некоторых особенностей белка.Часть трудности в учащейся полимеразе РНК, которая я – то, что это – большая молекула, чем полимераза РНК II.

Когда они определили его 3-мерную структуру, ученые нашли, что некоторые ‘дополнительные’ модули в полимеразе РНК я удивительно подобен другому, отдельные белки что полимераза РНК II потребностей сделать ее работу. Кажется, что полимераза РНК я постоянно принес те модули помощника на борту. В другой части молекулы Мюллер и коллеги нашли, что полимераза РНК I, кажется, объединила то, что в полимеразе РНК II два, разделяют модули на единственный, многозадачный компонент.

Вместе, эти изменения, вероятно, объясняют, почему полимераза РНК я могу произвести молекулы РНК по более быстрому уровню, чем полимераза РНК II.Результаты также подразумевают, что у клетки есть меньше способов управлять полимеразой РНК, я – деятельность, так как это не может влиять на него, изменяя доступность белков помощника, как это делает в случае полимеразы РНК II. Но здесь, также, полимераза РНК я – стратегия швейцарского ножа, предоставляет решение.

Структура показала, что у этой молекулярной машины есть встроенный регулирующий механизм: это может мешать себе быть свойственным ДНК, сгибая петлю в ее структуре, чтобы заблокировать пространство, на которое обычно состыковывалась бы ДНК.Работа была выполнена в сотрудничестве с лабораторией Карлоса Фернандеса-Торнеро в Centro de Investigaciones Biologicas в Мадриде, Испания, а также исследователях в Университете G? ttingen, Германия и синхротрон SOLEIL во Франции, где некоторые структурные данные были получены.

Структурные данные были также получены в Петре III колец в Гамбурге EMBL в кампусе DESY в Германии.Кристоф Мюллер недавно получил Продвинутый Грант от European Research Council (ERC), чтобы изучить полимеразу РНК I и белки, с которыми это взаимодействует.